Das Institut kooperiert im Rahmen der wissenschaftlichen Gesellschaft für Montage, Handhabung und Industrierobotik (WGMHI) mit den dort vertretenden Professuren in Forschung und Lehre auf nationaler Ebene. Professor Schüppstuhl ist seit 2011 Gründungsvorstand der WGMHI.
An der TU-Hamburg findet die Kooperation innerhalb von Forschungsschwerpunkten (FSP) statt. Das IFPT ist Mitglied der nachfolgenden Forschungsschwerpunkte, wobei Professor Schüppstuhl das Sprecheramt des Schwerpunktes für Digitale Produktion, Logistik und MRO übernommen hat.
Mit nachfolgenden Unternehmen fand oder findet eine Zusammenarbeit im Rahmen von öffentlichen oder industriellen Forschungsprojekten statt:
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